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一、PCR扩增过程的关键点
1、PCR 扩增中随着拷贝数的增加经常会出现二聚体、非特异性条带(大小不对)的现象。
通过降低模板和引物浓度、降低镁离子浓度、适当减少酶量,提高退火温度,可以提高扩增特异性。此外引物设计的好坏是关键。除了按照常规引物设计规则外,构建载体时通常会在引物序列上添加酶切位点和保护碱基。
2、扩增的片段拖尾严重,产物在凝胶上出现弥散状态。
原因可能在于模板不纯、反应体系中各成分比例不合适、退火温度设置偏低、循环次数过多等。注意操作轻柔,PCR 扩增体系各组分严格参照说明书加入。
3、片段太长难扩增、发生错配概率大、测序出现点突变。
扩增中设置适宜的退火温度(60℃ 左右),循环次数(30 次左右)不要太多,酶量要适中。传统 Taq 酶便宜高效,但扩增长度有限,出错率高。针对少量模板、复杂模板、长片段、稳定性差模板、高 GC 含量模板的扩增,选取具有高扩增能力、高保真、可靠性强的聚合酶是解决问题的重要一环。
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